Fue el creador del proyecto del Instituto de Medicina Legal y de la Morgue en la República Argentina, realizó investigaciones sobre el Paludismo, el Cólera, la Obstetricia y la Ginecología, fue Presidente de la Academia de Medicina, en reemplazo del Dr. Malbrán, y publicó junto al profesor Juan B. Fernández el "Atlas de Anatomía y de Clínica Obstétrica Normal y Patológica", traducido a cuatro idiomas, publicó la Obra: Historia de la Facultad de medicina, en cuatro tomos, y recibió a lo largo de su carrera reconocimientos a nivel nacional y mundial entre los que se destacan La Legión de Honor en el Grado de Chanceller, otorgada por el gobierno de Francia, un premio a la Obra "Historia de la Medicina del Río de la Plata", otorgada por la Real Academia de la Historia y presidida por el Rey Alfonso XII, en ese mismo año dicho Rey le entrega el Diploma y la Medalla en el cuál se lo acredita como "Comendador de Número de la Orden Civil de Alfonso XII", entre otros hechos importantísimos.
Eliseo Cantón murió en Buenos aires el 21 de Junio de 1931, su cuerpo fue cremado y enterrado en el patio interior la Iglesia Fundacional de la Ciudad de Lules, bajo el jazminero que acompañó sus días de lectura en aquellas mañanas de verano.
